Após atualizar a versão do Zend Framework tive problema com o registerAutoload. Isso porque desde a versão 1.8 o Zend_Loader::registerAutoload está obsoleto. Meu código estava mais ou menos assim:
include('Zend/Loader.php');
Zend_Loader::registerAutoload();
Para solucionar o problema basta usar o Zend_Loader_Autoloader. Em minha implementação apenas o trecho abaixo resolveu o problema:
include('Zend/Loader/Autoloader.php');
$autoloader = Zend_Loader_Autoloader::getInstance();